Краевед, историк Москвы. До революции служил в Иностранной экспедиции Московского почтамта, публиковал статьи по краеведению в газетах и журналах. Участник революции 1905 г. С 1909 г. - член Комиссии по изучению старой Москвы (с 1909).
После революции был хранителем музея "Старая Москва" (с 1919 г.). Способствовал сохранению исторических кладбищ, охране памятников истории и культуры Москвы. В 1924-1926 г. - научный сотрудник Коммунального музея. Читал лекции в Академии Коммунистического воспитания. Заведовал Обществом изучения памятников Подмосковья.
Неоднократно подвергался арестам, как при царе, так и при большевиках (последний раз в 1935 г.). С 1939 г. -
учёный секретарь в Комитете истории Москвы при Институте Истории Академии наук СССР. В годы Великой отечественной войны работал над составлением летописи Москвы.
Скончался П.Н. Миллер 23 января 1943 года, похоронен в Москве на Новодевичьем кладбище (2 уч. 34 ряд ), рядом с другим историком Москвы
Н.П. Чулковым.