Психиатр, психотерапевт, один из организаторов российского психоаналитического движения. Доктор медицинских наук (1901), профессор. Работал в различных клиниках. В 1900 г. защитил докторскую диссертацию на тему "Материалы к учению о клиническом значении мышечного валика у душевно-больных". В 1901-1918 гг. - приват-доцент Московского университета, одновременно заведовал Московским Центральным полицейским приёмным покоем (ныне научный центр социальной и судебной психиатрии им. В.П. Сербского). В 1920 г. А.Н. Бернштейн (совм. с Ф.Е. Рыбаковым), содействовал созданию Московского психоневрологического института, с 1921 г. его директор.
Основные научные труды учёного посвящены прикладной и экспериментальной психопатологии, психиатрической диагностике и методологии. В 1912 г. он впервые описал шизофреническое слабоумие. Исследовал эпилепсию, описал один из признаков олигофрении. Широкое распространение получил способ Бернштейна для определения восприимчивости памяти при помощи таблиц с геометрическими фигурами.
Скончался А.Н. Бернштейн в 1922 году, похоронен в Москве на Новодевичьем кладбище (3 уч. 7 ряд). Рядом с ним похоронены:
его жена
Бернштейн Александра Карловна (1867-1942), их сыновья:
Бернштейн Н.А. и
Бернштейн С.А.;
Гурвич Наталья Александровна (1912-1968) - жена Н.А. Бернштейна;
Бернштейн Татьяна Сергеевна (1902-1992) - жена С.А. Бернштейна, биолог, научный сотрудник Института физкультуры; сын С.А. Бернштейна
Бернштейн А.С., а также
Миропольская Маргарита Михайловна (1937-2009), вероятно, жена А.С. Бернштейна.