Хирург, онколог. Один из основоположников отечественной экспериментальной и клинической онкологии. С его именем связано рождение целого ряда научных направлений: ранняя диагностика рака, тотальные и парциальные резекции органов (он первый выполнил полное удаление желудка с лимфаденэктомией), общерезорбтивная химиотерапия и регионарная химиотерапия. Является составителем первого в мире онкологического научного сборника (1913).
В 1911-1919 гг. - директор Института для лечения раковых и злокачественных опухолей им. Морозовых (ныне - НИИ онкологии им. Герцена).
В 1912-1919 гг. - экстраординарный профессор кафедры хирургической госпитальной клиники Московского университета.
В 1919-1920 гг. - главный хирург военного госпиталя Красной Армии на Кудринской улице.
Скончался В.М. Зыков в 1920 году, похоронен в Москве на Новодевичьем кладбище (3 уч. 7 ряд). На памятнике ошибочно написано, что В.М. Зыков является основателем первого в России онкологического института. Основателем этого института был Лев Львович Левшин (1842-1911), а В.М. Зыков возглавил этот институт после его смерти.