Политработник ВМФ СССР, вице-адмирал (1951). Член ВКП (б) с 1927 года. На флоте с 1929 г. Участник боевых действий у озера Хасан. После окончания в 1939 г. Высших военно-политических курсов ВМФ СССР - военный комиссар лёгкого крейсера "Киров" Балтийского флота.
С июня того же года - член Военного совета Балтийского флота. Участник Советско-финляндской войны. В начале Великой Отечественной войны был привлечён к партийной ответственности "за примиренческое отношение к крупным недостаткам на БФ, проявленную личную панику в первые дни войны и непринятие им решительных мер по ликвидации панических настроений у подчиненных". Снят с занимаемой должности. Служил в должностях: военный комиссар, заместитель начальника политотдела Азовской военной флотилии, заместитель по политчасти начальника Технического Управления ВМФ. С сентября 1942 г. - дивизионный комиссар. С июня 1943 г. - член Военного совета Амурской флотилии. Участвовал в боях на речных рубежах реки Амура, Сунгари, озера Хасан, в Маньчжурской стратегической операции. После войны занимал различные должности, с 1950 г. - член Военного совета Северного флота. В апреле 1952 г. снят с должности, как не справившийся с возложенными на него обязанностями. С сентября 1953 г. - заместитель по политчасти начальника Военно-морского строительного управления Министерства обороны СССР. С 1956 г. - в запасе.
Скончался М.Г. Яковенко 9 февраля 1963 года, похоронен на Новодевичьем кладбище (8 уч. 23 ряд), с ним похоронены:
Яковенко Нина Васильевна (1910-2002) - его жена;
Яковенко Клара Марковна (1935-2020) - его дочь; и
Поелуев Авенир Павлович (1923-2009) - инженер, возможно, муж К.М. Яковенко.
