Агроном-овощевод, специалист в области селекции и семеноводства овощных культур. Лауреат Сталинской премии (1946). Академик ВАСХНИЛ (1948).
В 1937-1966 г. работала директором Грибовской овощной селекционной станции.
Под её руководством выведен ряд новых сортов овощных культур:
дыня Грунтовая Грибовская; дыня для Севера; капуста Осенняя Грибовская; петрушка Сахарная 11;
сельдерей Грибовский 7; фасоль Сахарная Грибовская 804; бобы Белорусские; лук многолетний; чеснок озимый; шпинат, эстрагон. Опубликовала около 150 научных работ, включая 11 книг и брошюр. Имеет государственные награды.
Скончалась Е.И. Ушакова в 1964 году, похоронена в Москве на Новодевичьем кладбище (8 уч. 44 ряд).