Советский военачальник, генерал армии (1953), Герой Советского Союза (1945). Участник советско-финляндской войны 1939-1940 г.
В годы Великой Отечественной войны - начальник штаба 16-й армии Западного фронта (1941-1942), начальникк штаба Брянского, Донского, Центрального,
Белорусского, и 1-го Белорус, фронтов (1942-1945). Принимал участие в подготовке и проведении операций по разгрому немецких войск под Москвой,
Сталинградом и Курском, а также в Белоруссии, Варшавско-Познанской, Восточно-Померанской и Берлинской операциях. После войны М.С. Малинин был начальником штаба Группы советских оккупационных войск в Германии. С 1948 года - начальник Главного штаба - заместитель Главнокомандующего Сухопутных войск СССР. С 1950 года - первый заместитель, а с 1951 года - Главный инспектор Советской Армии. С 1952 года до последних дней жизни - первый заместитель начальника Генерального штаба Вооружённых Сил СССР. В 1956 г. участвовал в разработке подавления войсками Советской армии восстания в Венгрии.
Скончался М.С. Малинин 24 января 1960 года, похоронен в Москве на Новодевичьем кладбище (3 уч. 65 ряд),
рядом с ним в 2001 году похоронили его супругу
Малинину (Грекову) Н.Г. и в 2018 г. сына
М.М. Малинина