Советский государственный деятель. Один из руководителей органов государственной безопасности страны.
Член РСДРП с 1903 года. Участник Октябрьской революции. В 1917-1921 годах - член коллегии ВЧК, в 1919-1920 годах - заместитель председателя
ВЧК, одновременно являлся председателем Особого трибунала ВЧК и заместителем председателя Верховного трибунала при ВЦИК.
В 1921 г. участвовал в ликвидации Кронштадтского антисоветского мятежа. В 1922-1925 годах - управделами ЦК партии.
Делегат 10-го, 12-го и 13-го съездов партии. Избирался членом ВЦИК.
Скончался И.К. Ксенофонтов 23 марта 1926 года, похоронен в Москве на Новодевичьем кладбище (1 уч. 44 ряд). Рядом с ним похоронены его близкие.