Композитор, дирижер, педагог, музыкально-общественный деятель.
В 1899–1906 г. был дирижером Московской частной русской оперы Саввы Мамонтова и оперного театра Зимина, Большого театра. В течение многих лет - профессор, а в 1905-1922 гг. - директор (с 1919 г. - ректор) Московской консерватории. Писал оперы, кантаты, симфонические и камерно-инструментальные произведения, вокальные ансамбли, романсы и песни, хоры и т. д.
В своей музыке композитор опирался на традиции русской классики, в некоторых сочинениях использовал фольклор народов Кавказа и Средней Азии. Известностью пользовались его симфоническая поэма "Мцыри" (1924), сюита для оркестра "Кавказские эскизы" (1894), опера "Ася" (1900).
Ипполитов-Иванов завершил и инструментовал по эскизам автора неоконченную оперу
М.П. Мусоргского
"Женитьба" (1931). Автор книги "50 лет русской музыки в моих воспоминаниях" (1934). В 1924 г. имя Ипполитова-Иванова было присвоено музыкальному училищу, в 1996 г. – образованному на его основе Музыкально-педагогическому институту в Москве.
Скончался М.М. Ипполитов-Иванов 28 января 1935 г. похоронен в Москве на Новодевичьем кладбище (2 уч. ряд 21а).