Писатель, мемуарист. Участник революционного движения 1870-80-х гг., подвергался арестам, ссылкам.
Произведения Елпатьевского преимущественно носят характер воспоминаний и путевых очерков, изображают быт сельского духовенства ("Рассказы
о прошлом"), жизнь "люмпенов", каторжан, сибирских поселенцев и национальных меньшинств, угнетенных царским правительством
("Окаянный город" и др.). Произведения: "Очерки Сибири" (1893);
мемуары "Близкие тени" (т. 1-2, 1909-16), "За границей" (1910), "Египет" (1911), "Крымские очерки" (1913), "Воспоминания за 50 лет" (1929) и др.
После революции 1917 г. С.Я. Елпатьевский работал врачом в Москве.
Скончался С.Я. Елпатьевский 9 января 1933 года, похоронен в Москве, на Новодевичьем кладбище (1 уч.).