Военный деятель, генерал-полковник (1970). В РККА с 1937 г. С 1939 г. - начальник химической службы учебного батальона 14-й танковой бригады. Участник советско-финской войны. С 1941 г. адьютант в штабах. В дальнейшем на различных должностях в бронетанковых подразделениях.
C марта 1945 г. - начальник штаба 16-й самоходно-артиллерийской бригады. Отличился в битве за Кавказ, в Белорусской и Берлинской наступательных операциях,
несколько раз был ранен. После войны продолжил службу в танковых войсках. Окончил в 1950 г. Военную академию имени М.В. Фрунзе, а в 1957 г. - Высшую военную академию имени К.Е. Ворошилова. Командовал танковыми дивизиями в Одесском военном округе, в Северной группе войск.
В 1964-1967 г. - главный военный советник в Сирии. С 1968 г. заместитель командующего Туркестанского военного округа, с 1970 г. - командующий Туркестанского военного округа. Автор книги воспоминаний "На самых южных рубежах" (издана в 1979 г.).
Скончался С.Е. Белоножко 10 октября 1978 года, похоронен в Москве на Новодевичьем кладбище (7 уч. 14 ряд). Рядом с ним похоронена жена,
Белоножко Тамара Васильевна (1924-2009).